Spp 002 nl#157
Open
karenwuyts wants to merge 25 commits intomainfrom
Open
Conversation
…teps, replacement
This manually solves the effect of issue inbo/protocolhelper#133 in the spp_002_nl branch, which isn't yet part of a pull request.
spp-002-nl: fix _bookdown.yml output dir
| --> | ||
| ``` | ||
|
|
||
| **Celgekoppelde type**: celgebaseerde habitat(sub)type of regionaal belangrijk biotoop waarbij een GRTS-rastercel het type bevat |
Contributor
There was a problem hiding this comment.
verwarrende definitie, alternatief: GRTS rastercelwaaraan een habitat(sub)type of rbb is toegekend obv ruimtelijke overlap
|
|
||
| **Celgekoppelde type**: celgebaseerde habitat(sub)type of regionaal belangrijk biotoop waarbij een GRTS-rastercel het type bevat | ||
|
|
||
| **Celkartering**: het ruimtelijk in kaart brengen van het voorkomen van het doeltype binnen een rastercel van 32 m op 32 m, welke resulteert in de celkarteringpolygoon |
Contributor
There was a problem hiding this comment.
celkarteringpolygoon?? wat is dat dan?
| Ze worden getrokken uit het meetnetspecifieke steekproefkader, welke de best beschikbare oplijsting vormt van de eenheden die tot de doelpopulatie van het meetnet behoren. | ||
| Het steekproefkader van een meetnet is een beperking van het basissteekproefkader van alle meetnetten van de MNM op basis van de lijst types die de doelpopulatie van elk meetnet definiëren. | ||
| Per meetnet kunnen er extra ruimtelijke restricties gelden binnen types van het basissteekproefkader. | ||
| Het basissteekproefkader is aangemaakt op basis van originele datalagen en datalagen die zijn afgeleid van de Habitatkaart of de Watervlakkenlaag, en bevatten bestaande locatie-evaluaties. |
Contributor
There was a problem hiding this comment.
locatie-evaluties??
Habitatkaart en Watervlakkenlaag referenties of linken toevoegen
|
|
||
| De getrokken steekproefeenheden dienen het doeltype te bevatten waarvoor de eenheid is getrokken, welke is afgeleid van de meest recente Habitatkaart. | ||
| Het doeltype dient voor te komen ofwel in het celmidden bij celmiddengekoppelde types of ergens in de cel bij celgekoppelde types. | ||
| Toch kan het zijn dat in de praktijk de actueel aanwezige vegetatie in (het celmidden van) de rastercel ter plaatse afwijkt en niet behoort tot het doeltype waarvoor de meetlocatie is getrokken. |
Contributor
There was a problem hiding this comment.
wegens fouten in het (basis)steekproefkader
| Het doeltype dient voor te komen ofwel in het celmidden bij celmiddengekoppelde types of ergens in de cel bij celgekoppelde types. | ||
| Toch kan het zijn dat in de praktijk de actueel aanwezige vegetatie in (het celmidden van) de rastercel ter plaatse afwijkt en niet behoort tot het doeltype waarvoor de meetlocatie is getrokken. | ||
| In het steekproefkader van celmiddengekoppelde types wordt een correctie toegepast op basis van het aandeel habitat in de polygoon (de phab-waarde). | ||
| Die correctie houdt in dat polygonen (of stukken daarvan volgens level3-cellen) met een lagere phab proportioneel minder worden opgenomen in het steekproefkader. |
Contributor
There was a problem hiding this comment.
level 3 cellen???
| In het steekproefkader van celmiddengekoppelde types wordt een correctie toegepast op basis van het aandeel habitat in de polygoon (de phab-waarde). | ||
| Die correctie houdt in dat polygonen (of stukken daarvan volgens level3-cellen) met een lagere phab proportioneel minder worden opgenomen in het steekproefkader. | ||
| Hierdoor vergroot de kans dat de terreinmedewerker een bemonstering kan uitvoeren tijdens het bezoek aan een gebied. | ||
| Echter, waar zulke polygoonen dan resteren en getrokken worden, moeten ze wel een geldige eenheid opleveren (als ze die bevatten), anders genereer je bias. |
Contributor
There was a problem hiding this comment.
polygonen ipv polygoonen
Contributor
There was a problem hiding this comment.
ik zou die bias voor de duidelijkheid dan specifiek omschrijven. Ik interpreteer dat dus habitats en rbbs met typisch lage phab waarden ondervertegenwoordigd dreigen te zijn in de steekproef, correct?
|
|
||
| Als de steekproefeenheid of vervangeenheid geschikt is, dient in de geschikte rastercel een kartering te worden uitgevoerd van het doeltype, verderop de celkartering genoemd. | ||
| Met deze informatie zijn veldmedewerkers zonder of met minder vegetatiekundige expertise in staat de bemonstering of installatie van meettoestellen op een vegetatiekundig geschikte locatie uit te voeren. | ||
| Dit kan met tussenkomst zijn van een extra randomisatie in de geschikte zone. |
Contributor
There was a problem hiding this comment.
Suggested change
| Dit kan met tussenkomst zijn van een extra randomisatie in de geschikte zone. | |
| Dit kan met tussenkomst zijn van een extra randomisatie in de geschikte deelzone van de vervangeenheid. |
|
|
||
| Het veldwerk in dit protocol kan enkel uitgevoerd worden: | ||
|
|
||
| - binnen de (sub)optimale periode voor kartering en is afhankelijk van het doeltype (zie) |
|
|
||
| Dit protocol is van toepassing voor de evaluatie, vervanging en celkartering van terrestrische eenheden van GRTS-steekproeven getrokken voor abiotische monitoring in een meetnet van de MNM, met uitzondering van het habitattype 7220. | ||
|
|
||
| ### Beperkingen van de procedure |
Contributor
There was a problem hiding this comment.
is kennis van de vegetatiekundige definitie en de herkenning daarvan op terrein ook geen vereiste (alvast voor het gedeelte celkartering en evaluatie?)
| @@ -0,0 +1,24 @@ | |||
| # Extra benodigdheden t.o.v. de subprotocols | |||
Contributor
There was a problem hiding this comment.
suggestie om beeld toevoegen van enkele van de benodigde materialen?
|
|
||
| - Als het niet overeenkomt met het doeltype, wordt aansluitend gezocht naar een vervanging door een geschikte rastercel in dezelfde polygoon (zie \@ref(lokalevervanging)). | ||
|
|
||
| - Indien een geschikte rastercel gevonden wordt, zal deze de originele steekproefeenheid vervangen (maar beide GRTS-rangnummers worden behouden in de databank). Aansluitend wordt een celkartering uitgevoerd. |
Contributor
There was a problem hiding this comment.
Suggested change
| - Indien een geschikte rastercel gevonden wordt, zal deze de originele steekproefeenheid vervangen (maar beide GRTS-rangnummers worden behouden in de databank). Aansluitend wordt een celkartering uitgevoerd. | |
| - Indien een geschikte rastercel gevonden wordt, zal deze de originele steekproefeenheid vervangen (maar beide GRTS-rangnummers worden behouden in de databank). Aansluitend wordt een celkartering uitgevoerd in de vervangcel |
| - Als het niet overeenkomt met het doeltype, wordt aansluitend gezocht naar een vervanging door een geschikte rastercel in dezelfde polygoon (zie \@ref(lokalevervanging)). | ||
|
|
||
| - Indien een geschikte rastercel gevonden wordt, zal deze de originele steekproefeenheid vervangen (maar beide GRTS-rangnummers worden behouden in de databank). Aansluitend wordt een celkartering uitgevoerd. | ||
| - Indien geen geschikte rastercel gevonden wordt, is geen lokale vervanging mogelijk en wordt de steekproefeenheid verwijderd uit de steekproef. |
Contributor
There was a problem hiding this comment.
Suggested change
| - Indien geen geschikte rastercel gevonden wordt, is geen lokale vervanging mogelijk en wordt de steekproefeenheid verwijderd uit de steekproef. | |
| - Indien geen geschikte vervangcel gevonden wordt, is geen lokale vervanging mogelijk en wordt de steekproefeenheid verwijderd uit de steekproef. |
|
|
||
| Alle andere terrestrische doeltypes (met uitzondering van habitattype 7220) dienen aanwezig te zijn in het celmidden. | ||
| Voor de kalktufbronnen (habitattype 7220) is de populatie‐eenheid de volledige habitatvlek (met variabele, doorgaans beperkte oppervlakte), geïdentificeerd met een punt gekoppeld aan de vlek. | ||
| De evaluatie van dit doeltype gebeurt dus niet op niveau van rastercellen maar de hele vlek. |
Contributor
There was a problem hiding this comment.
Suggested change
| De evaluatie van dit doeltype gebeurt dus niet op niveau van rastercellen maar de hele vlek. | |
| De evaluatie van dit doeltype gebeurt dus niet op niveau van rastercellen maar de hele vlek en valt dus buiten het bestek van voorliggend protocol. |
|
|
||
| **Let op**: een steekproefeenheid kan voor meer dan één doeltype zijn getrokken. | ||
| Dit is het gevolg van het feit dat een polygoon in de Habitatkaart, waarop de waarden van de rastercellen zijn gebaseerd, meer dan één type (habitat of rbb) kan bevatten, in relatieve verhoudingen zoals weergegeven met de zogenaamde phab-waarden. | ||
| In het celmidden kan er echter normaliter maar één type voorkomen en dus sluiten types die celmiddengebaseerd zijn elkaar uit. |
Contributor
There was a problem hiding this comment.
Suggested change
| In het celmidden kan er echter normaliter maar één type voorkomen en dus sluiten types die celmiddengebaseerd zijn elkaar uit. | |
| In het celmidden zal er echter in realiteit normaliter maar één type voorkomen en dus sluiten types die celmiddengebaseerd zijn elkaar uit. |
| ## Desktopscreening van steekproefeenheden en zijn vervangeenheden {#desktop} | ||
|
|
||
| Om grote, duidelijke fouten in de steekproef op te sporen, dient een steekproefeenheid en zijn steekproefeenheden onderworpen te worden aan een eerste visuele screening. | ||
| Hiervoor dient de rastercel van de steekproefeenheid ruimtelijk gevisualiseerd te worden (vb. met QGIS) in combinatie met een aantal GIS-lagen in de meest recente versie, zoals orthofoto's (zomer- en winteropnames), de Habitatkaart, de Watervlakkenlaag en het Digitaal Hoogtemodel Vlaanderen. |
Contributor
There was a problem hiding this comment.
Suggested change
| Hiervoor dient de rastercel van de steekproefeenheid ruimtelijk gevisualiseerd te worden (vb. met QGIS) in combinatie met een aantal GIS-lagen in de meest recente versie, zoals orthofoto's (zomer- en winteropnames), de Habitatkaart, de Watervlakkenlaag en het Digitaal Hoogtemodel Vlaanderen. | |
| Hiervoor dient de rastercel van de steekproefeenheid ruimtelijk gevisualiseerd te worden (vb. in QGIS) in combinatie met een aantal GIS-lagen in de meest recente versie, zoals orthofoto's (zomer- en winteropnames), de Habitatkaart, de Watervlakkenlaag en het Digitaal Hoogtemodel Vlaanderen. |
|
|
||
| Controleer in de GIS-applicatie wie de eigenaar en/of beheerder is van het gebied waarin de steekproefeenheid gelegen is. | ||
| Toets af bij de meetnetverantwoordelijke of projectcoördinator of vergunningen noodzakelijk zijn en je bezoek is gemeld bij de eigenaar en/of beheerder. | ||
| Toegankelijkheid van militaire gebieden dient een week voor het terreinbezoek aangevraagd te worden via mail aan het betreffende kwartier, met de boswachter in cc. |
|
|
||
| ### Evalueer de toegankelijkheid en bezoek de steekproefeenheid | ||
|
|
||
| Is het terrein waar de steekproefeenheid gelegen is ontoegankelijk, duid dit aan in de GIS-applicatie en vermeld de reden en de vermoedelijke duur van ontoegankelijkheid. |
Contributor
There was a problem hiding this comment.
Suggested change
| Is het terrein waar de steekproefeenheid gelegen is ontoegankelijk, duid dit aan in de GIS-applicatie en vermeld de reden en de vermoedelijke duur van ontoegankelijkheid. | |
| Indien het terrein, waar de steekproefeenheid gelegen is, ontoegankelijk is, duid dit aan in de GIS-applicatie en vermeld de reden en de vermoedelijke duur van ontoegankelijkheid. |
|
|
||
| Is het terrein waar de steekproefeenheid gelegen is ontoegankelijk, duid dit aan in de GIS-applicatie en vermeld de reden en de vermoedelijke duur van ontoegankelijkheid. | ||
| Mogelijke redenen zijn: overstroming, afsluiting, broedseizoen, beheerwerken, enz. | ||
| Is het terrein wel toegankelijk, navigeer je naar het steekproefeenheid. |
Contributor
There was a problem hiding this comment.
Suggested change
| Is het terrein wel toegankelijk, navigeer je naar het steekproefeenheid. | |
| Is het terrein wel toegankelijk, navigeer je naar de steekproefeenheid. |
| Eens je je in de nabijheid van de meetlocatie bevindt (vb. op 10 m), navigeer je met behulp van de RTK-GPS-ontvanger naar de exacte locatie van het centrum van de steekproefeenheid. | ||
|
|
||
| **Let op**: in de rastercel kan een permanent kwadraat van het meetnet biotische habitatkwaliteit aanwezig zijn. | ||
| Het is 3 m op 3 m groot en bevindt zich ten noordwesten van het celmidden: het celmidden van de rastercel is het zuidoostelijk hoekpunt van het permanent kwadraat. |
Contributor
There was a problem hiding this comment.
figuurtje toevoegen
|
|
||
| - voor de evaluatie van de aanwezigheid van habitat(sub)types 1320, 2150, 6210_sk, 6430_bz en 7150 en de rbb‐types brem‐ en gaspeldoornstruweel (rbbsg) en doornstruweel (rbbsp) is het voldoende dat het doeltype ergens in de 32 m x 32 m rastercel aanwezig is. | ||
| - voor alle andere terrestrische types (behalve 7220) dient het doeltype aanwezig te zijn in het midden van de rastercel. | ||
| - specifiek voor type |
Contributor
There was a problem hiding this comment.
onvolledig, vermoedelijk gaat het hier over 7220??
| De bepaling van het aanwezige habitat(sub)type of rbb gebeurt met behulp van de [veldsleutels](https://www.vlaanderen.be/inbo/de-biologische-waarderingskaart/bwk-handleiding-veldsleutels/). | ||
| Het doeltype moet op minstens 9 m^2^ aanwezig zijn binnen de rastercel, uitgezonderd bij habitattype 7150, daar wordt de ondergrens van 4 m^2^ gehanteerd. | ||
|
|
||
| Door veranderingen op het terrein, onnauwkeurigheden in de afbakening van de types of het voorkomen van complexen in de karteringen kan het type afwijken van het type op de Habitatkaart. |
Contributor
There was a problem hiding this comment.
Suggested change
| Door veranderingen op het terrein, onnauwkeurigheden in de afbakening van de types of het voorkomen van complexen in de karteringen kan het type afwijken van het type op de Habitatkaart. | |
| Door veranderingen op het terrein, onnauwkeurigheden in de afbakening van de types of het voorkomen van complexen in de karteringen kan het in de praktijk voorkomende type afwijken van het type op de Habitatkaart. |
| Door veranderingen op het terrein, onnauwkeurigheden in de afbakening van de types of het voorkomen van complexen in de karteringen kan het type afwijken van het type op de Habitatkaart. | ||
| Bijgevolg dienen we steeds het type te bepalen met behulp van de veldsleutels. | ||
| Het schaalniveau waarop de sleutel dient toegepast te worden, is niet dat van het celmidden, maar deze van de min of meer homogene vegetatievlek waarin het celmidden zich bevindt. | ||
| Om de finale beslissing te maken of het punt wordt meegenomen in de steekproef, wordt een denkbeeldig 3 m x 3 m-proefvlak beoordeeld ten noordwesten van het celmidden. |
Contributor
There was a problem hiding this comment.
dit toch alleen van celmiddengekoppelde types veronderstel ik?
Contributor
There was a problem hiding this comment.
en waarom checken we een denkbeeldige 9m² ten NW van centrum? ik zou logischerwijs denken gewoon rondom centroid van de rastercel (door die NW ga je mogelijks ook weer verstoring van de MHQ plots in de hand werken...)
| Het schaalniveau waarop de sleutel dient toegepast te worden, is niet dat van het celmidden, maar deze van de min of meer homogene vegetatievlek waarin het celmidden zich bevindt. | ||
| Om de finale beslissing te maken of het punt wordt meegenomen in de steekproef, wordt een denkbeeldig 3 m x 3 m-proefvlak beoordeeld ten noordwesten van het celmidden. | ||
|
|
||
| **Onderstaande beslisregels worden gehanteerd voor het bepalen of de steekproefeenheid al dan niet geschikt is.** |
Contributor
There was a problem hiding this comment.
gaat dit nu enkel over die denkbeeldige 9m² of over de volledige rastercel???
Contributor
There was a problem hiding this comment.
en dus enkel van toepassing voor de centroidgebaseerde types lijkt me
| - specifiek voor type | ||
|
|
||
| De bepaling van het aanwezige habitat(sub)type of rbb gebeurt met behulp van de [veldsleutels](https://www.vlaanderen.be/inbo/de-biologische-waarderingskaart/bwk-handleiding-veldsleutels/). | ||
| Het doeltype moet op minstens 9 m^2^ aanwezig zijn binnen de rastercel, uitgezonderd bij habitattype 7150, daar wordt de ondergrens van 4 m^2^ gehanteerd. |
Contributor
There was a problem hiding this comment.
waarom afwijken voor en alleen voor 7150??
| **Onderstaande beslisregels worden gehanteerd voor het bepalen of de steekproefeenheid al dan niet geschikt is.** | ||
|
|
||
| - De rastercel maakt deel uit van een homogene, grotere vegetatievlek van het doeltype (minimum 9 m^2^) -\> de steekproefeenheid is geschikt. | ||
| - De rastercel bevat naast het doeltype ook (een) ander habitattype en zijn ruimtelijk duidelijk van elkaar gescheiden (bv. bos naast een heideterrein, ven) |
Contributor
There was a problem hiding this comment.
opnieuw onduidelijk wegens eerder vermelde regels, indien het centroid in 10m2 doelvegetatie ligt dan doet het aandeel meer of minder dan 50% er toch niet meer toe??
| ## Lokale vervanging van niet-geschikte steekproefeenheden {#lokalevervanging} | ||
|
|
||
| Blijkt, na het doorlopen van bovenstaande stappen, dat de steekproefeenheid **het doeltype niet bevat**, dan doorloop je aansluitend de procedure voor het vinden van een geschikte vervangeenheid. | ||
| Je gaat hierbij in (een deel van) de polygoon waarin de niet-geschikte steekproefeenheid gelegen is, op zoek naar een vervangeenheid dat wel het doeltype bevat. |
Contributor
There was a problem hiding this comment.
Suggested change
| Je gaat hierbij in (een deel van) de polygoon waarin de niet-geschikte steekproefeenheid gelegen is, op zoek naar een vervangeenheid dat wel het doeltype bevat. | |
| Je gaat hierbij in (een deel van) de polygoon waarin de niet-geschikte steekproefeenheid gelegen is, op zoek naar een vervangeenheid die wel het doeltype bevat. |
| Deze ruimtelijke beperking van vervanging bij grote habitatpolygonen is reeds doorgevoerd in de lijst van mogelijke vervangeenheden in de GIS-applicatie. | ||
|
|
||
| De mogelijke vervangeenheden worden pas gevisualiseerd in de GIS-applicatie wanneer je hebt aangeduid dat een lokale vervanging nodig is en die gegevens hebt opgeslagen (zoals vermeld in \@ref(terplekke)). | ||
| De mogelijke vervangeenheden zijn genummerd en dienen in die volgorde zoals beschreven in het protocol geëvalueerd te worden tot er een vervanging mogelijk is. |
Contributor
There was a problem hiding this comment.
Suggested change
| De mogelijke vervangeenheden zijn genummerd en dienen in die volgorde zoals beschreven in het protocol geëvalueerd te worden tot er een vervanging mogelijk is. | |
| De mogelijke vervangeenheden zijn genummerd en dienen in die volgorde geëvalueerd te worden tot er een vervanging mogelijk is. |
| Voldoet een eerstvolgende vervangeenheid, dan vink je dit aan in de GIS-applicatie. | ||
| Op dat moment stopt de vervangprocedure; sla de gegevens op in de GIS-applicatie. | ||
|
|
||
| Werd een lokale vervangeenheid gevonden, voer dan de celkartering en markering uit zoals hiervoor beschreven in \@ref(celkartering). |
Contributor
There was a problem hiding this comment.
Suggested change
| Werd een lokale vervangeenheid gevonden, voer dan de celkartering en markering uit zoals hiervoor beschreven in \@ref(celkartering). | |
| Eens een lokale vervangeenheid gevonden, voer dan de celkartering en markering uit zoals hiervoor beschreven in \@ref(celkartering). |
| Blijkt dat de steekproefeenheid of zijn vervangeenheid **het doeltype bevat**, dan voer je aansluitend een celkartering en markering uit. | ||
| De celkartering houdt in dat je ter plaatse beoordeelt waar het doeltype actueel aanwezig is in de 32 m op 32 m rastercel. | ||
|
|
||
| ### Plaats een markering |
Contributor
There was a problem hiding this comment.
suggestie: foto toevoegen
| Oriënteer jezelf op het terrein met behulp van de locatie van het celmidden, de visuele voorstelling van de rastercel en de Habitatkaart in de GIS-applicatie. | ||
| Recente orthofoto's kunnen ook hierbij helpen. | ||
| Je kan ook navigeren naar (één van) de vier hoekpunten van de rastercel om het gebied binnen de rastercel af te bakenen. | ||
| Dit kan ook letterlijk met behulp van bamboestokken. |
Contributor
There was a problem hiding this comment.
Suggested change
| Dit kan ook letterlijk met behulp van bamboestokken. | |
| Gebruik eventueel 4 bamboestokken om de hoekpunten te markeren |
Contributor
Patrikoosterlynck
left a comment
Patrikoosterlynck
left a comment
There was a problem hiding this comment.
@karenwuyts ik ben er grondig doorgegaan
Over algemeen vind ik de begrippenlijst nogal moeilijk gedefinieerd, maar in het document wordt wel snel duidelijk wat er nu juist bedoeld wordt. Verder zit er in de werkwijze een voor mij onduidelijkheid in de regels (meer/minder dan 50% van de cel bepaald of het effectief een steekproeflocatie wordt...?). Misschien gaat het over die 9m² die men dient te beoordelen ipv de ganse rastercel? Enfin, werkwijze kan wel helderder. Als die stappen in een flowchart steken zou ook wel een meerwaarde zijn denk ik. (verdere opsmuk met wat fotootjes van materialen kan ook nog)
Author
Bedankt voor het grondige nalezen @Patrikoosterlynck . Ik bekijk nog met Ward de onduidelijkheid. Goed idee van de flowchart en de foto's. |
This file contains hidden or bidirectional Unicode text that may be interpreted or compiled differently than what appears below. To review, open the file in an editor that reveals hidden Unicode characters.
Learn more about bidirectional Unicode characters
Sign up for free
to join this conversation on GitHub.
Already have an account?
Sign in to comment
4 participants
Add this suggestion to a batch that can be applied as a single commit.This suggestion is invalid because no changes were made to the code.Suggestions cannot be applied while the pull request is closed.Suggestions cannot be applied while viewing a subset of changes.Only one suggestion per line can be applied in a batch.Add this suggestion to a batch that can be applied as a single commit.Applying suggestions on deleted lines is not supported.You must change the existing code in this line in order to create a valid suggestion.Outdated suggestions cannot be applied.This suggestion has been applied or marked resolved.Suggestions cannot be applied from pending reviews.Suggestions cannot be applied on multi-line comments.Suggestions cannot be applied while the pull request is queued to merge.Suggestion cannot be applied right now. Please check back later.
Description
Project-specific protocol on the location evaluation and local replacement of sample units in terrestrial habitat types, for the Monitoring Programme for the Natural Environment (Meetnetten Natuurlijk Milieu, MNM).
Related Issue
Task list
Steps by contributor:
protocolhelper::check_frontmatter()and address themprotocolhelper::check_structure()and address themNEWS.RmdReview steps for the author(s):
protocolhelper::check_frontmatter()andprotocolhelper::check_structure()succeeded without errors.To be done by an administrator after review: see guidelines for admins.