如图,当 pysam 读取索引缺失的 BAM 文件时,会输出 “Could not retrieve index file” 警告信息,即使后续分析并不会用到索引。建议不输出该警告信息。 <img width="785" alt="image" src="https://github.com/CycloneSEQ-Bioinformatics/Bamboo/assets/56027973/717f1e35-c668-467f-8ca5-75169729587c">
如图,当 pysam 读取索引缺失的 BAM 文件时,会输出 “Could not retrieve index file” 警告信息,即使后续分析并不会用到索引。建议不输出该警告信息。