-
Notifications
You must be signed in to change notification settings - Fork 0
Expand file tree
/
Copy pathfunctions.py
More file actions
293 lines (238 loc) · 12.4 KB
/
functions.py
File metadata and controls
293 lines (238 loc) · 12.4 KB
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
161
162
163
164
165
166
167
168
169
170
171
172
173
174
175
176
177
178
179
180
181
182
183
184
185
186
187
188
189
190
191
192
193
194
195
196
197
198
199
200
201
202
203
204
205
206
207
208
209
210
211
212
213
214
215
216
217
218
219
220
221
222
223
224
225
226
227
228
229
230
231
232
233
234
235
236
237
238
239
240
241
242
243
244
245
246
247
248
249
250
251
252
253
254
255
256
257
258
259
260
261
262
263
264
265
266
267
268
269
270
271
272
273
274
275
276
277
278
279
280
281
282
283
284
285
286
287
288
289
290
291
292
293
import pickle
import os
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
from collections import Counter
from sklearn.decomposition import PCA
from sklearn.metrics import silhouette_score
from inspect import signature
def load_descriptors(path):
with open(path, 'rb') as file:
return pickle.load(file)
def save_descriptors(df, desc_name, save_folder='Data'):
"""Сохраняет DataFrame df в формате pkl по заданному имени дескриптора.
Args:
df (pd.DataFrame): DataFrame для сохранения.
desc_name (str): Название дескриптора.
save_folder (str): Папка для сохранения файла.
"""
os.makedirs(save_folder, exist_ok=True)
save_path = os.path.join(save_folder, f'{desc_name.replace(" ", "_").lower()}.pkl')
df.to_pickle(save_path)
print(f"===> Сохранено: {save_path}")
def dataset_overview(df, name="DataFrame"):
print(f"\n--- Обзор: {name} ---")
print(f"Размер (строк, столбцов): {df.shape}")
print("\nИнформация о типах данных:")
print(df.info())
print("\nСтатистика по числовым столбцам:")
print(df.describe())
print("\nКоличество пропущенных значений по столбцам:")
print(df.isnull().sum())
print(f"\nКоличество дублирующихся строк: {df.duplicated().sum()}")
print('--' * 20)
def get_descriptor_length(df, name):
sample_vector = df['features'].iloc[0]
print(f"{name}: длина дескриптора = {len(sample_vector)}")
print('--' * 20)
def split_and_save_filtered_columns(df,
desc_name,
columns_to_remove=None,
save_folder='Data'
):
"""
Удаляет указанные столбцы из df и сохраняет результат.
Args:
df (pd.DataFrame): Исходный DataFrame.
desc_name (str): Название дескриптора (для имени файла).
columns_to_remove (list): Список названий столбцов для удаления.
save_folder (str): Папка для сохранения.
"""
columns_to_remove = columns_to_remove or []
# Лог до удаления
print(f"\n=== Обработка дескриптора: {desc_name} ===")
print(f"Изначально столбцов: {len(df.columns)}")
print(f"Будет удалено столбцов: {columns_to_remove}")
# Проверка что все столбцы есть в df
missing_cols = [col for col in columns_to_remove if col not in df.columns]
if missing_cols:
raise ValueError(f"Ошибка: указанные столбцы не найдены в df: {missing_cols}")
# Удаление столбцов
df_filtered = df.drop(columns=columns_to_remove)
# Лог после удаления
print(f"Осталось столбцов после удаления: {len(df_filtered.columns)}")
# Сохраняем
save_descriptors(df_filtered, desc_name, save_folder)
def clustering_evaluation(df,
desc_name='Descriptor',
cluster_model_cls=None,
cluster_model_params=None,
k_range=range(2, 10),
metrics=None,
fixed_k=None,
selected_pca_cols=None
):
"""
Оценивает кластеризацию для выбранных pca_* колонок DataFrame.
Parameters:
df (pd.DataFrame): DataFrame с колонками pca_*
desc_name (str): Имя дескриптора
cluster_model_cls (type): Класс модели кластеризации (например, KMeans)
cluster_model_params (dict): Параметры модели
k_range (range): Диапазон k для подбора (если fixed_k не задан)
metrics (list of tuples): [(метрика, имя_метрики), ...]
fixed_k (int): Фиксированное k (если задано)
selected_pca_cols (list): Список колонок pca_* для кластеризации
"""
cluster_model_params = cluster_model_params or {}
metrics = metrics or [(silhouette_score, 'silhouette_score')]
# По умолчанию ищем все pca_* колонки
if selected_pca_cols is None:
selected_pca_cols = [col for col in df.columns if col.startswith('pca_')]
uses_k = 'n_clusters' in signature(cluster_model_cls).parameters
print(f"\n=== Оценка кластеризации: {desc_name} ===")
for col in selected_pca_cols:
print(f"\n Колонка: {col}")
X = np.vstack(df[col].values)
for metric_func, metric_name in metrics:
best_k, best_score = None, None
k_values = [fixed_k] if fixed_k else k_range
if uses_k:
for k in k_values:
params = cluster_model_params.copy()
params['n_clusters'] = k
model = cluster_model_cls(**params)
labels = model.fit_predict(X)
if len(set(labels)) <= 1:
continue
score = metric_func(X, labels)
if (best_score is None or
(metric_name == 'davies_bouldin_score' and score < best_score) or
(metric_name != 'davies_bouldin_score' and score > best_score)):
best_k, best_score = k, score
if best_score is not None:
print(f"{metric_name}: Лучшее k = {best_k}, score = {best_score:.4f}")
else:
print(f"{metric_name}: Недостаточно кластеров")
else:
model = cluster_model_cls(**cluster_model_params)
labels = model.fit_predict(X)
mask = labels != -1
print(f"Кластеры: {Counter(labels)}")
if mask.sum() > 1 and len(set(labels[mask])) > 1:
score = metric_func(X[mask], labels[mask])
print(f"{metric_name}: score = {score:.4f}")
else:
print(f"{metric_name}: Недостаточно данных для оценки")
def perform_pca_and_save_df(df,
desc_name='Descriptor',
selected_scalers=None, # список скейлеров для обработки (['robust_scaled', ...])
explained_variance_threshold=0.95,
max_components=None, # новое: максимальное число компонент (None — без ограничения)
save_folder='Data',
draw_plots=True
):
"""
Выполняет PCA для выбранных скейлеров в df и сохраняет обратно df с новыми колонками pca_*.
Args:
df (pd.DataFrame): загруженный DataFrame (scaled_* колонки уже есть)
desc_name (str): имя дескриптора для сохранения
selected_scalers (list): список колонок, по которым делать PCA. Если None — все.
explained_variance_threshold (float): порог накопленной дисперсии
max_components (int or None): максимальное число компонент PCA
save_folder (str): куда сохранять результат
draw_plots (bool): рисовать ли графики explained variance
"""
print(f"\n=== Обработка дескриптора: {desc_name} ===")
all_scaler_cols = ['standard_scaled', 'minmax_scaled', 'robust_scaled']
scaler_cols = all_scaler_cols if selected_scalers is None else selected_scalers
for col in scaler_cols:
if col not in df.columns:
print(f"Пропущено {col} — колонки нет в df")
continue
print(f" PCA для {col}")
X = np.vstack(df[col].values)
pca_full = PCA().fit(X)
cum_var = np.cumsum(pca_full.explained_variance_ratio_)
n_components = np.argmax(cum_var >= explained_variance_threshold) + 1
if max_components is not None:
n_components = min(n_components, max_components)
print(f"-> Оптимальное число компонент: {n_components}")
X_pca = PCA(n_components=n_components, random_state=42).fit_transform(X)
df[f'pca_{col}'] = list(X_pca)
if draw_plots:
plt.figure(figsize=(8, 5))
plt.plot(cum_var, marker='.')
plt.axhline(y=explained_variance_threshold, color='r', linestyle='--')
plt.axvline(x=n_components - 1, color='g', linestyle='--')
plt.title(f"{desc_name} — {col} — Explained Variance")
plt.xlabel('Число компонент')
plt.ylabel('Накопленная дисперсия')
plt.grid(True)
plt.tight_layout()
plt.show()
save_descriptors(df, f'pca_scaled_{desc_name}', save_folder=save_folder)
def plot_samples_images(data,
cluster_col,
cluster_label,
descriptor_name="Unknown Descriptor", # добавил параметр
nrows=3,
ncols=3,
figsize=(12, 5),
base_dir="Data/raw_data"
):
"""Функция для визуализации изображений из указанного кластера."""
# Фильтруем по кластеру
samples_indexes = np.array(data[data[cluster_col] == cluster_label].index)
np.random.shuffle(samples_indexes)
paths = data.loc[samples_indexes, 'image_path']
# График
fig, axes = plt.subplots(nrows, ncols)
fig.set_size_inches(*figsize)
fig.suptitle(
f"Descriptor: {descriptor_name} | Cluster column: {cluster_col} | Cluster #{cluster_label}",
fontsize=16
)
for i in range(nrows):
for j in range(ncols):
path_idx = i * ncols + j
# Безопасно выбираем ось
ax = axes[i, j] if nrows > 1 and ncols > 1 else axes[max(i, j)]
if path_idx >= len(paths):
ax.axis('off')
continue
# Приводим путь к полному (с учётом base_dir)
path = paths.iloc[path_idx]
full_path = os.path.join(base_dir, path.replace("\\", "/"))
try:
img = plt.imread(full_path)
ax.imshow(img)
except Exception as e:
print(f"Ошибка при чтении изображения: {full_path} ({e})")
ax.imshow(np.zeros((10, 10, 3))) # Пустая картинка
ax.axis('off')
plt.tight_layout()
plt.show()
def plot_outliers(df,
base_dir,
descriptor,
cluster_col='cluster_DBSCAN'
):
outliers = df[df[cluster_col] == -1]
if outliers.empty:
print(f"Выбросов не найдено для {descriptor}")
return
print(f"Выводим выбросы для {descriptor}")
sample = outliers.sample(min(9, len(outliers)))
plt.figure(figsize=(12, 6))
for i, (_, row) in enumerate(sample.iterrows()):
img_path = f"{base_dir}/{row['image_path'].replace('\\', '/')}"
try:
img = plt.imread(img_path)
plt.subplot(3, 3, i+1)
plt.imshow(img)
plt.axis('off')
except:
continue
plt.suptitle(f"Выбросы: {descriptor}")
plt.show()